pj-bb

Bonjour,

J'essaye de traduire cette page : http://folding.stanford.edu/FAQ-diseases.html

Elle est consacrée aux recherches sur les maladies étudiées dans le cadre du projet Folding@Home. Mon objectif est de pouvoir l'utiliser (fichier pdf) en complément de courriers de communication qui seront à entête de l'association des Fermiers Généreux. Eventuellement, elle pourra être transmise en html à Stanford pour mise en ligne d'une version française.

Afin de ne pas abuser au niveau longueur, je vous proposerai en plusieurs fois mes traductions. Elles ne sont pas forcément parfaitement fidèles et sont relativement techniques.

Merci de votre aide.
Cordialement,

PJ-BB
www.fermiers-genereux.org

Texte original : Folding@Home FAQ on diseases studied

INTRODUCTION
The Folding@Home project ("FAH") is dedicated to understanding protein folding, the diseases which result from protein misfolding and aggregation, and novel computational ways to develop new drugs in general. Here, we briefly describe our goals, what we are doing, and some highlights so far.

We feel strongly that a distributed computing project must not just run calculations on millions of PC's, but d.c. projects must produce results, especially in the form of peer reviewed publications, public lectures, and other ways to disseminate the results from FAH to the greater scientific community. Below, we also detail our progress in these areas as well.

WHAT IS PROTEIN FOLDING AND HOW IS IT RELATED TO DISEASE?
Proteins are necklaces of amino acids --- long chain molecules. Proteins are the basis of how biology gets things done. As enzymes, they are the driving force behind all of the biochemical reactions which make biology work. As structural elements, they are the main constituent of our bones, muscles, hair, skin and blood vessels. As antibodies, they recognize invading elements and allow the immune system to get rid of the unwanted invaders. For these reasons, scientists have sequenced the human genome -- the blueprint for all of the proteins in biology -- but how can we understand what these proteins do and how they work?
However, only knowing this sequence tells us little about what the protein does and how it does it. In order to carry out their function (e.g. as enzymes or antibodies), they must take on a particular shape, also known as a "fold." Thus, proteins are truly amazing machines: before they do their work, they assemble themselves! This self-assembly is called "folding."
What happens if proteins don't fold correctly? Diseases such as Alzheimer's disease, Huntington's disease, cystic fibrosis, BSE (Mad Cow disease), an inherited form of emphysema, and even many cancers are believed to result from protein misfolding. When proteins misfold, they can clump together ("aggregate"). These clumps can often gather in the brain, where they are believed to cause the symptoms of Mad Cow or Alzheimer's disease.
WHICH DISEASES OR BIOMEDICAL PROBLEMS ARE YOU CURRENTLY STUDYING?

ALZHEIMER'S DISEASE (AD) is caused by the aggregation of relatively small (42 amino acid) proteins, called Abeta peptides. These proteins form aggregates which even in small clumps appear to be toxic to neurons and cause neuronal cell death involved in Alzheimer's Disease and the horrible neurode
neurodegenerative consequences.


We have many calculations being performed on AD. Our primary goals are the prediction of AD aggregate structure for rational drug design approaches as well as further insight into how AD aggregates form kinetically (hopefully paving the way for a method to stop the AD aggregate formation).
There have been many projects, including 500 series and 700 series. So far, all of them are either Tinker WUs or normal (not bigWU) Gromacs WUs.
July 2005: We are currently in the process of submitting our first paper on FAH results.
October 2005: FAH researchers Vishal Vaidyanathan and Nick Kelley present the recent FAH results on AD at BCATS 2005. Their work won the best talk award in 2005.

November 2005: Prof. Vijay Pande presented recent FAH work on AD at the National Parkinson's Foundation conference (in the session on AD and its connections to PD).


Traduction proposée : FAQ de Folding@Home sur les maladies étudiées

INTRODUCTION
Le projet Folding@Home ("FAH") est consacré à la compréhension du repliement des protéines, aux maladies qui résultent du repliement anormal et de la formation de blocs de protéïnes, et aux méthodes informatiques novatrices pour développer de nouveaux médicaments en général. Ici, nous décrivons brièvement nos buts, nos travaux, et détaillons quelques points particuliers.
Nous estimons qu'un projet de calcul distribué ne doit pas se contenter de répartir des calculs sur des millions de PC mais doit susciter des résultats qui seront publiés dans des revues professionnelles, feront l'objet de conférences publiques, et seront diffusés par tous les moyens à la communauté scientifique la plus large. Dans ce document, nous détaillons également nos progrès dans ces domaines.
QU'EST-CE QUE LE PLIAGE DE PROTEINE ET QUEL RAPPORT AVEC LA MALADIE ?
Les protéines, composées de longues chaînes d’acides aminés, sont à la base du fonctionnement biologique. En tant qu'enzymes, elles accélèrent les réactions chimiques du métabolisme. Ce sont aussi les principaux éléments constituant les os, les muscles, les cheveux, la peau et les vaisseaux sanguins. En tant qu'anticorps, elles sont utilisées par le système immunitaire pour détecter et neutraliser les intrus comme les bactéries et les virus. C'est la raison pour laquelle les scientifiques ont séquencé le génome humain – le plan de fabrication de toutes les protéines en biologie -- mais comment pouvons-nous comprendre ce que font ces protéines et leur fonctionnement ?
Cependant, simplement connaître la séquence de la structure primaire de la protéïne déterminé par le gène nous renseigne peu sur ce qu'elle fait et la manière de le faire. Avant de remplir leur fonction (par exemple comme enzymes ou anticorps), elles doivent prendre une forme particulière, ce qu'on appelle aussi un "pli", Ainsi, les protéines sont véritablement des machines étonnantes : avant d'effectuer leur travail, elles s'assemblent ! Cet auto-assemblage s'appelle le "repliement."
QUE SE PASSE-T-IL SI LES PROTEINES NE SE PLIENT PAS CORRECTEMENT?
Des maladies telles que la maladie d'Alzheimer, la maladie de Huntington, la fibrose cystique, l'ESB (la maladie de la vache folle), une forme héritée d'emphysème, et même beaucoup de cancers résultent vraisemblablement d'un repliement anormal de protéine. Quand les protéines se plient mal, elles peuvent se grouper ensemble (former un "agrégat"). Ces blocs se rassemblent souvent dans le cerveau et occasionnent les symptômes de la maladie de la vache folle ou d'Alzheimer.
QUELLES MALADIES OU PROBLÈMES BIOMÉDICAUX ÉTUDIEZ-VOUS ACTUELLEMENT?

LA MALADIE D'ALZHEIMER (AD) est provoquée par l'agrégation de fragments de protéines (l'acide aminé 42), appelées bêtas peptides amyloïdes ou Aß toxiques. Ces protéines forment des plaques qui même en petits blocs endommagent les cellules du nerf du cerveau, ayant pour résultat l'ensemble des symptômes observés dans la maladie d'Alzheimer et les sévères conséquences de la dégénérescence des neurones.

Beaucoup de calculs ont été effectués sur la Maladie d'Alzheimer. Nos premiers objectifs sont de prévenir la formation des plaques de la maladie d'Alzheimer pour faire avancer la conception rationnelle de médicaments aussi bien que d'améliorer la compréhension de la façon dont la maladie d'Alzheimer agrège sa forme cinétiquement (préparant le chemin avec optimisme pour qu'une méthode puisse arrêter la formation de la plaque liée à la maladie d'Alzheimer).

Il y a eu beaucoup de projets sur la maladie d'Alzheimer, comprenant les series 500 et les series 700. Jusqu'ici, ils ont tous été calculés avec des unités de travail (WUs – Work Units) issues soit du code TINKER, soit du code Gromacs.
Juillet 2005: Nous sommes à ce moment en train de soumettre notre premier rapport sur les résultats de FAH.
Octobre 2005: Les chercheurs de FAH Vishal Vaidyanathan et Nick Kelley présentent les résultats récents de FAH sur la maladie d'Alzheimer au BCATS 2005 (biomedicalcomputationatstanford, un symposium de Stanford sur la simulation biomédicale). Leur travail a gagné la meilleure récompense en 2005.
November 2005: Le Professeur Vijay Pande a présenté le travail récent de FAH sur la maladie d'Alzheimer à la conférence de la Fondation Nationale Parkinson - NPF (une intervention sur la maladie d'Alzheimer et ses liaisons avec la maladie de Parkinson).

The_FD

Je n'ai pas encore tout lu mais déjà une question avant d'aller plus loin...

"repliment de protéine" c'est voulu? parce que ce n'est pas l'expression consacrée en français. Est ce que tu veux aussi des corrections sur les termes technique de biologie moléculaire?

Quels seront les lecteurs potentiels du texte, niveau scientifique?

__________________
L'histoire de la famille Bourdillon
Les fêtes d'Hébé
The flying dancer dancing

pj-bb

Désolé pour les fautes d'orthographe éventuelles en français ...Dans certains cas, j'observe que pour "folding", certains traductions indiquent "repliement" et dans d'autres "pliage" . En fait, toutes vos observations/suggestions me seront utiles car les lecteurs potentiels ne seront pas des scientifiques mais seront des associations ou des particuliers en accompagnement d'une lettre de communication sur le thème du F@H.. L'essentiel est donc surtout d'éviter une erreur d'interprétation. Pour les termes techniques, je pense ne pas avoir commis d'erreurs, m'étant relativement documenté sur le sujet.

Cordialement,
PJ

The_FD

heu non la faute d'orthographe c'est peut etre moi qui l'ai ajoutée

en tout cas voici ce que je corrigerais, je ne me suis pas forcément rapproché du texte source, lui même contenant quelques approximation biologiques...

FAQ de Folding@Home sur les maladies étudiées

INTRODUCTION
Le projet Folding@Home ("FAH") est consacré à la compréhension du repliement des protéines, aux maladies qui résultent du repliement anormal et de la formation de blocs de protéïnes, et aux méthodes informatiques novatrices pour développer de nouveaux médicaments en général. Ici, nous décrivons brièvement nos buts, nos travaux, et détaillons quelques points particuliers.

Nous estimons qu'un projet de calcul ne doit pas se contenter de répartir des calculs sur des millions de PC mais doit susciter des résultats qui seront publiés dans des revues professionnelles, feront l'objet de conférences publiques, et seront diffuser par tous les moyens à la communauté scientifique la plus large. Dans ce document, nous détaillons également nos progrès dans ces domaines.

QU'EST-CE QUE LE PLIAGE DES PROTEINES ET QUEL RAPPORT AVEC LA MALADIE ?
Les protéines, composées de longues chaînes d’acides aminés, sont à la base du fonctionnement biologique. En tant qu'enzymes, elles accélèrent les réactions chimiques du métabolisme. Ce sont aussi les principaux éléments constituant les os, les muscles, les cheveux, la peau et les vaisseaux sanguins. En tant qu'anticorps, elles sont utilisées par le système immunitaire pour détecter et neutraliser les intrus comme les bactéries et les virus. C'est la raison pour laquelle les scientifiques ont séquencé le génome humain – le plan de fabrication de toutes les protéines du corps -- mais comment pouvons-nous comprendre ce que font ces protéines et leur fonctionnement ?

Le simple fait de connaître la séquence de la structure primaire de la protéïne

(tu peux peut être remplacer par "connaitre la suite de nucléotides dont est formée une protéine, suite")

déterminée par le gène correspondant à la protéine, nous donne des indices sur ce qu'elle fait et la manière de le faire. Avant de remplir leur fonction (enzymes ou anticorps par exemple), les protéines doivent prendre une forme particulière, ce qu'on appelle aussi un "pli". Ainsi, les protéines sont véritablement des machines étonnantes : avant d'effectuer leur travail, elles s'assemblent ! Cet auto-assemblage s'appelle le "repliement."

QUE SE PASSE-T-IL SI LES PROTEINES NE SE PLIENT PAS CORRECTEMENT?
Des maladies telles que la maladie d'Alzheimer, la maladie de Huntington, la fibrose cystique, l'ESB (la maladie de la vache folle), une forme héritée d'emphysème, et même beaucoup de cancers résultent vraisemblablement d'un repliement anormal de protéine. Quand les protéines se plient mal, elles peuvent se grouper ensemble (former un "agrégat"). Ces blocs se rassemblent souvent dans le cerveau et occasionnent les symptômes de la maladie de la vache folle ou d'Alzheimer.

QUELLES MALADIES OU PROBLÈMES BIOMÉDICAUX ÉTUDIEZ-VOUS ACTUELLEMENT?
LA MALADIE D'ALZHEIMER (AD) est provoquée par l'agrégation de fragments de protéines (42 acides aminés), appelés bêtas peptides amyloïdes ou Aß toxiques. Ces fragments de protéines forment des plaques qui, même en petits blocs, endommagent les cellules () du cerveau, ayant pour résultat l'ensemble des symptômes observés dans la maladie d'Alzheimer et les sévères conséquences de dégénérescence des neurones.

Beaucoup de calculs ont été effectués sur la Maladie d'Alzheimer. Nos premiers objectifs sont d'une part de prévenir la formation des plaques () pour faire avancer la conception rationnelle de médicaments, et d'autre part améliorer la compréhension du phénomène d'agrégation dans l'espoir d'empécher la formation des plaques nocives.

Il y a eu beaucoup de projets, incluant les series 500 et les series 700. Jusqu'ici, ils ont tous été calculés avec des unités de travail (WUs – Work Units) issues soit du code TINKER, soit du code Gromacs.
Juillet 2005: Nous soumettons notre premier rapport sur les résultats de FAH.
Octobre 2005: Les chercheurs de FAH Vishal Vaidyanathan et Nick Kelley présentent les résultats récents de FAH sur la maladie d'Alzheimer au BCATS 2005 (biomedicalcomputationatstanford, un symposium de Stanford sur la simulation biomédicale). Leur travail a gagné la meilleure récompense en 2005.
November 2005: Le Professeur Vijay Pande a présenté le travail récent de FAH sur la maladie d'Alzheimer à la conférence de la Fondation Nationale Parkinson - NPF (une intervention sur la maladie d'Alzheimer et ses liaisons avec la maladie de Parkinson).

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Les fêtes d'Hébé
The flying dancer dancing

pj-bb

Merci pour cette réponse si rapide.

Je vais prendre en compte tes remarques.

Cordialement,

PJ

Il Tifoso

Page Web traduite et mise au format PDF.
Donne-moi ton adresse Email pour que je t'envoie le fichier PDF

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Bruno FIOREZZI
"Nessun nasce Maestro. Bisogna prima esser Garzone e poi Maestro." (Giuseppe Giusti)

pj-bb

Je vous remercie aussi pour votre participation , mais en fait j'arrive sans problème à traduire la page approximativement. Ce que je souhaite, c'est juste éviter des erreurs d'interprétation de ma part (contre-sens), c'est pourquoi je préfère vous proposer mes traductions pour vérification.

Cordialement,

PJ

www.fermiers-genereux.org